Рубероид применяют для прочности гидроизоляции перед заливкой пола. Можно и без него обойтись, только зачем будет дороже. Гидроизоляционные мастики вредные для органов дыхания.
Рубероид, если его просто уложить, не образует сплошного гидроизолирующего слоя, т.к. имеются стыки между полосами. Хоть и нахлест будет, а вода щель найдет. Или его надо склеивать с помощью горелки или еще как. Уж этот-то процесс куда более вредным для органов дыхания будет, чем применение современного гидроизолирующего намазочного материала, например, флехендихт, представляющего собой водную эмульсию латекса без растворителей (ну, кроме собственно воды).