По логике, плесень образуется при положительной температуре и высокой влажности, и все это на фоне отсутствия вентиляции. То что прибили не просушенную вагонку, может влиять только на ее последующую геометрию т.е. при просыхании может повести, выйти из пазов и т. д. Синева появилась от того, что вагонка сделана из леса срубленного летом. Обычно, деловой лес рубят зимой, когда заканчивается сокодвижение в деревьях. Иногда, особенно когда очень нужны деньги, могут продавать и летний лес. Вот тогда посинение почти гарантировано. Но это не грибок. Синева на качество, кроме эстетики не влияет. Синеву можно отбелить специальными отбеливателями. Что касается плесени, то это результат протапливания вашей печки. Вы создали подходящие условия -см. начало. Бороться нужно путем удаления плесени обработкой антисептиком, далее либо постоянно топить чтобы все просушить, либо не топить вообще, в результате за зиму все само постепенно просохнет. Только особое внимание нужно обратить на вентиляцию. Как мне кажется вы не сделали паропроницаемую изоляцию, вседствии чего конденсат и садится на стены.