Вообще, если почитать чего пишут по аккумуляторы, то все сходятся во мнении, что сильно глубокий разряд вреден, особенно SLA (свинцово-кислотные) и Ni-Mh. При этом часто говорят о неприхотливости Ni-Cd - он и самый морозостойкий, вплоть до возможности зарядки при отрицательных температурах, и хранить его надо пустым, и легко реанимируется как после длительного хранения, так и после глубокого разряда. Про Li-Ion я практически молчу, ибо его основные проблемы - холод и старение - не связаны с режимами зарядки/разрядки, которые контролируются встроенной в Li-ion аккумулятор микросхемой.
SLA в электроинструментах не пользуется, а следовательно главным пострадавшим от глубокого разряда остается Ni-Mh, и рекомендация разряжать аккум. естественным путем, т.е. во время работы, относится, главным образом, к нему.
По крайней мере, такое осчучение сложилось у меня, после прочтения десятка тематических статей.. )