Если у автора есть желание поставить фильтр - ну пусть поставит - только после отсечных кранов - в конце концов, когда задолбается их чистить после каждого слива воды из стояка и запуска сеточки можно просто выкинуть 
- ну останутся корпуса фильтров в системе - ничего страшного.
Ни в коем случае не ставить фильтры до отсечных кранов - после перезапуска стояка могут забиться сразу и наглухо - и что бежать опять выключать стояк? И после включения опять и опять?
Здесь правильно говорят, что фильтры не нужны, если в системе много мути - зачем её собирать? Пусть уж лучше пролетает насквозь....
Но разные куски ржи лежащие внутри ПС из нержи могут привести к точечной коррозии - надо бы их оттуда как-то убирать если уж такая ржавая и старая система ГВС
Как?
- Снимать ПС и промывать, отводы - кратковроменным открытием кранов, или не кратковременным - одеть шланг от пылесоса и сливать в ванну
- Не снимать ПС, а поставить после отсечных сливные краны - и промывать потоком воды в одну и другую сторону закрывая по очереди один и другой отсечные и открывая противоположный сливной. К сливному приспособить гибкий шланг в ванную.
PS У меня в доме тоже старые стальные трубы. Но вода чистая и не ржавая - редко прилетает какой нибудь небольшой кусочек ржи. Фильтры ГО даже и не ставил - проще раз в три месяца вытрясти из сеточек пару крупинок ржавчины. Когда менял разводку внутри квартиры - решил промыть отвод (10см отвод + шаровый) на всякий случай мощным потоком. Одел толстый гибкий шланг и открыл шаровый наполную - сильно удивился, когда чистейшая горячая вода стала темно-коричневой буквально через минуту слива. Потом сливал эту коричневую субстанцию минут двадцать, пока вода не начала светлеть.
По хорошему эту процедуру лучше периодически делать в подвале, чтобы промыть лежак ГВС от мути на дне трубы и кусочков ржи. Закрыть обратку, и открыть спускник на подаче - думаю там хорошие экземпляры прилетят, если в кран пролезут
PPS От автора неплохо бы несколько фото + схему труб на ПС - уклоны, высоты, длина...